Disainikogu on muuseumi kõige uuem kollektsioon, mis loodi 1999. aastal unikaalsele tarbekunstile keskendunud kogude kõrvale eesmärgiga koondada süstemaatiliselt Eesti disaini puudutavat pärandit ja teavet. Kogu koosneb suures osas tootekujundust puudutavast materjalist 20. sajandi algusest tänaseni, Lutheri mööblist Stigo elektrirollerini. Siia kuulub ka muuseumi 1950. aastatest täienenud unikaalmööbli kogu. Väärtustatud on ka esemekogu toetav tekstiline ja pildiline materjal, millest suur osa on talletatud arhiivkogus.  Ajaloolise materjali osas on aktiivse kogumise fookus mahukal nõukogude perioodi pärandil, mille koondamine on toimunud vaid väga pikalt ajaliselt distantsilt. Kogu kasvab süstemaatiliselt ka kaasaegse disaini nii esemeid kui ideid kaardistavate näidetega ning alustatud selle täiendamist graafilist disaini puudutava materjaliga. Kogusse kuulub veidi üle 1200 museaali.